化學(xué)信息學(xué)(翟紅林)(第二版)
定 價:42 元
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- 作者:翟紅林 主編
- 出版時間:2025/8/1
- ISBN:9787122471369
- 出 版 社:化學(xué)工業(yè)出版社
- 中圖法分類:G254.97
- 頁碼:234
- 紙張:
- 版次:02
- 開本:16開
《化學(xué)信息學(xué)》是為大學(xué)本科生而編寫的化學(xué)信息學(xué)教材,共分為6章:第1章介紹了化學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ),內(nèi)容主要包括化學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展、基本概念、研究內(nèi)容與方法及其與實驗科學(xué)的關(guān)系,人工智能技術(shù)在化學(xué)中的應(yīng)用簡介;第2章介紹了化學(xué)結(jié)構(gòu)的計算機表示方法與特點、SMILES編碼與MOL格式文件、化學(xué)軟件ChemOffice與HyperChem的使用;第3章重點講述了基于網(wǎng)絡(luò)資源的化學(xué)文獻檢索方法與技巧、重要數(shù)據(jù)庫與學(xué)術(shù)期刊,文獻管理軟件EndNote的使用;第4章介紹了基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計與回歸建模分析、機器學(xué)習(xí)與深度學(xué)習(xí)及其實現(xiàn)簡介;第5章介紹了正交試驗設(shè)計與均勻試驗設(shè)計等;第6章主要介紹了分子力學(xué)與分子模擬初步。
《化學(xué)信息學(xué)》可作為高等學(xué);瘜W(xué)、化工、材料、生物、環(huán)境等相關(guān)專業(yè)本科生化學(xué)信息學(xué)課程的基礎(chǔ)教材。由于所涉及內(nèi)容、技術(shù)與方法等具有一定的普適性,本書也可作為相關(guān)領(lǐng)域科研人員和研究生的參考用書。
翟紅林,蘭州大學(xué),教授、博士生導(dǎo)師。 1986年6月蘭州大學(xué)化學(xué)系物理化學(xué)本科專業(yè)畢業(yè)獲學(xué)士學(xué)位并留校工作至今。2004年12月獲蘭州大學(xué)分析化學(xué)博士學(xué)位,2007年1月至2008年1月赴臺灣長庚大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究中心開展抗癌藥物設(shè)計及癌癥早期診斷的博士后研究工作。專業(yè)特長為數(shù)據(jù)建模與分析、程序設(shè)計與應(yīng)用;目前主要從事復(fù)雜體系中的多組分同時定性與定量分析、實驗條件優(yōu)化、分子模擬與藥物分子設(shè)計的化學(xué)與生物信息學(xué)及其在相關(guān)領(lǐng)域中應(yīng)用的教學(xué)與科研工作。已在TrAC-TrendsinAnalyticalChemistry、Analyst、AnalyticaChimicaActa、FoodChemistry、J.ChromatographyA、Talanta、J.SeparationScience、J.ChemicalInformationandModeling、ChemometricsandIntelligentLaboratorySystems、ChemicalBiology&DrugDesign、ComputationalBiology&Chemistry等國內(nèi)外學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表研究論文六十余篇;已主持并完成國家自然科學(xué)基金面上項目及多項校企橫向課題。
第1章緒論1
本章要點1
1.1信息與信息學(xué)1
1.1.1信息1
1.1.2信息學(xué)2
1.2化學(xué)信息與化學(xué)信息學(xué)3
1.2.1化學(xué)信息3
1.2.2化學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展5
1.3化學(xué)研究與人工智能8
1.3.1科學(xué)研究范式與人工智能8
1.3.2化學(xué)人工智能9
1.4化學(xué)信息學(xué)與實驗科學(xué)的關(guān)系11
1.5關(guān)于本教材12
思考與練習(xí)12
參考文獻與擴展閱讀12
第2章化學(xué)結(jié)構(gòu)的計算機表示14
本章要點14
2.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示14
2.1.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的一般表示及其特點14
2.1.2化學(xué)結(jié)構(gòu)的計算機表示方法15
2.2SMILES編碼17
2.2.1SMILES基本編碼17
2.2.2SMILES擴展編碼19
2.3其他線性編碼20
2.3.1SLN編碼20
2.3.2ROSDAL編碼20
2.3.3InChI標(biāo)識與InChIKey21
2.4化學(xué)結(jié)構(gòu)的二維表示及格式文件22
2.4.1連接表22
2.4.2格式文件23
2.5化學(xué)結(jié)構(gòu)的計算機處理26
2.5.1化學(xué)結(jié)構(gòu)的計算機輸入與可視化26
2.5.2ChemOffice/ChemBioOffice簡介29
2.5.3HyperChem簡介39
思考與練習(xí)44
參考文獻與擴展閱讀48
第3章化學(xué)文獻檢索與管理50
本章要點50
3.1文獻基礎(chǔ)知識50
3.1.1文獻檢索的意義50
3.1.2科技文獻的類型及其特點51
3.1.3重要的文獻源51
3.1.4科技文獻檢索方法與途徑53
3.2美國化學(xué)文摘(CA)55
3.2.1CA概況55
3.2.2SciFinder數(shù)據(jù)庫56
3.3科學(xué)引文索引與工程索引65
3.3.1科學(xué)引文索引(SCI)65
3.3.2Web of Science68
3.3.3工程索引(EI)78
3.4ScienceDirect與Reaxys數(shù)據(jù)庫80
3.4.1ScienceDirect數(shù)據(jù)庫80
3.4.2Reaxys數(shù)據(jù)庫81
3.5中文文獻檢索簡介87
3.5.1概述87
3.5.2中國知網(wǎng)87
3.6搜索引擎檢索92
3.7重要學(xué)術(shù)期刊簡介93
3.7.1電子期刊的興起93
3.7.2綜合性期刊94
3.7.3常見的化學(xué)化工類期刊94
3.8文獻管理軟件96
3.8.1文獻管理與軟件96
3.8.2EndNote簡介97
思考與練習(xí)105
參考文獻與擴展閱讀105
第4章常用數(shù)據(jù)處理方法107
本章要點107
4.1化學(xué)計量學(xué)簡介107
4.1.1計量與計量學(xué)107
4.1.2化學(xué)計量學(xué)的基本內(nèi)涵108
4.2化學(xué)數(shù)據(jù)的預(yù)處理109
4.2.1化學(xué)數(shù)據(jù)的基本特點109
4.2.2化學(xué)數(shù)據(jù)的基本描述110
4.2.3化學(xué)數(shù)據(jù)常用的預(yù)處理方法117
4.3線性回歸123
4.3.1回歸模型與最小二乘法123
4.3.2多元線性回歸分析126
4.4主成分分析與因子分析135
4.4.1主成分分析135
4.4.2因子分析139
4.5偏最小二乘分析及其應(yīng)用143
4.6深度學(xué)習(xí)與人工智能建模簡介146
4.6.1機器學(xué)習(xí)與人工智能建模的發(fā)展146
4.6.2人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與機器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)147
4.6.3深度學(xué)習(xí)建模的實現(xiàn)150
思考與練習(xí)150
參考文獻與擴展閱讀152
第5章試驗設(shè)計與優(yōu)化153
本章要點153
5.1試驗設(shè)計基礎(chǔ)153
5.2單因素優(yōu)選法155
5.2.1均分法與對分法155
5.2.2黃金分割法155
5.2.3分數(shù)法(斐波那契數(shù)列法)156
5.2.4其他方法介紹157
5.3正交試驗設(shè)計158
5.3.1正交試驗設(shè)計基礎(chǔ)158
5.3.2正交試驗設(shè)計的直觀分析法162
5.3.3正交試驗設(shè)計的方差分析法169
5.4均勻試驗設(shè)計173
5.4.1均勻試驗設(shè)計基礎(chǔ)173
5.4.2均勻試驗設(shè)計方法174
思考與練習(xí)178
參考文獻與擴展閱讀179
第6章分子力學(xué)與分子模擬180
本章要點180
6.1分子模擬方法概述180
6.2分子力學(xué)理論基礎(chǔ)181
6.2.1分子力學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展181
6.2.2分子力學(xué)的基本假定182
6.2.3分子力場構(gòu)成183
6.3分子力學(xué)勢能函數(shù)及力場參數(shù)化183
6.3.1鍵伸縮能183
6.3.2鍵角彎曲能186
6.3.3二面角扭曲轉(zhuǎn)動能187
6.3.4范德華相互作用能188
6.3.5靜電相互作用能189
6.3.6交叉項189
6.3.7分子力場參數(shù)化190
6.4常見的分子力場191
6.4.1常見的分子力場介紹191
6.4.2常見分子力場的選擇192
6.4.3分子力場存在的問題192
6.5分子力學(xué)與量子力學(xué)的比較193
6.6分子力場應(yīng)用193
6.6.1分子結(jié)構(gòu)的優(yōu)化194
6.6.2分子對接206
6.6.3分子動力學(xué)模擬209
6.7Schrdinger功能及分子對接簡介214
6.7.1Schrdinger功能簡介214
6.7.2Schrdinger中的分子對接簡介215
6.8分子力學(xué)發(fā)展趨勢225
思考與練習(xí)230
參考文獻與擴展閱讀231
附錄233
附錄1格魯布斯(Grubbs)臨界值表233
附錄2Q檢驗臨界值表233
附錄3t檢驗臨界值表234
附錄4F檢驗臨界值表234